Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
GAPVD1Q14C86 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
GAPVD1Q14C86 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
GAPVD1Q14C86 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
GAPVD1Q14C86 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
GAPVD1Q14C86 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
GAPVD1Q14C86 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
GAPVD1Q14C86 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
GAPVD1Q14C86 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
GAPVD1Q14C86 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
GAPVD1Q14C86 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
GAPVD1Q14C86 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
GAPVD1Q14C86 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
GAPVD1Q14C86 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms