Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CPSF7-206ENST00000448745 1749 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 GTF2H1-210ENST00000530496 1700 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 SERPINB13-201ENST00000269489 3206 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 CCDC152-201ENST00000361970 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 DLG2-218ENST00000524982 2872 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC127537.1-201ENST00000418183 748 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AP000997.1-201ENST00000424313 479 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC013399.1-201ENST00000450311 418 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC093799.1-201ENST00000452411 499 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 CMAHP-203ENST00000458373 1101 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 COX4I1P1-201ENST00000554239 509 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 CDC37L1-AS1-201ENST00000607997 463 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RNVU1-19-201ENST00000613023 167 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 PRDM2-203ENST00000343137 5797 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 BEND2-202ENST00000380033 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 CTNNA2-218ENST00000541047 2870 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 KLF5-205ENST00000539231 2951 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 HLTF-201ENST00000310053 5317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 NFIB-205ENST00000380959 8198 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 DPY19L3-205ENST00000586987 5925 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ZKSCAN5-201ENST00000326775 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 OR2V2-203ENST00000641791 4428 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 GJC1-201ENST00000330514 3295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 NTRK3-201ENST00000317501 3826 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC023886.2-201ENST00000321285 411 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 GIP-201ENST00000357424 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 LELP1-201ENST00000368747 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 SNORA7B-201ENST00000384360 139 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 FCAR-205ENST00000391723 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC090114.1-201ENST00000393266 448 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AL512882.1-201ENST00000436086 832 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AL121908.1-201ENST00000443055 668 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 MRPS21P1-201ENST00000453850 223 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC234782.3-201ENST00000461229 433 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC113352.1-201ENST00000513196 666 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 IGHV7-40-201ENST00000520963 296 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC079384.1-201ENST00000548506 600 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC126177.6-201ENST00000550420 1009 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
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