Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXC1Q12948 ZNF195-203ENST00000343338 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 MAP3K13-203ENST00000424227 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 SEMA3E-202ENST00000427262 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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