Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 FAM186A-201ENST00000327337 7127 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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