Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms