Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 OR8B9P-202ENST00000642028 5216 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 XIAP-201ENST00000355640 8584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 POU2F3-201ENST00000260264 2903 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 NPFFR2-204ENST00000395999 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 BTK-210ENST00000621635 2767 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 TRPC5-201ENST00000262839 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 ZNF19-210ENST00000567225 2838 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC024614.1-201ENST00000577546 307 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
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TRIM35Q9UPQ4 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC073488.2-201ENST00000631903 751 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 CACNA1D-201ENST00000288139 9341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 PCDH15-226ENST00000613657 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 ACOD1-201ENST00000377462 2165 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 LTBP1-207ENST00000418533 5164 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 CYFIP2-221ENST00000618329 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 PLXDC2-203ENST00000377252 12468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 MYO10-201ENST00000274203 11456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 FDPSP6-201ENST00000425091 512 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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TRIM35Q9UPQ4 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 LINC00489-201ENST00000457816 543 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL149P-201ENST00000465197 281 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 PRICKLE2-AS2-201ENST00000484703 496 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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