Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.1 ms