Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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USP35Q9P2H5 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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