Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.8 ms