Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LGSNQ5TDP6 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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