Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CYTH1Q15438 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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