Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms