Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 PDIK1L-202ENST00000374271 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CCDC150-201ENST00000389175 3685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 TLR3-202ENST00000504367 2310 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC018880.1-201ENST00000418898 1319 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CDY2B-201ENST00000382867 1961 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 DICER1-214ENST00000556045 2776 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 MAPK10-319ENST00000641459 2542 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LOXHD1-201ENST00000300591 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 FOPNL-206ENST00000573968 2039 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 DAZ2-206ENST00000382440 4119 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SERPINA6-201ENST00000341584 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ZNF415-213ENST00000597503 2469 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 GRIK1-AS1-202ENST00000412579 818 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AP000431.1-201ENST00000424219 469 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RN7SL332P-201ENST00000482163 254 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 pRNA.12-201ENST00000614353 90 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 pRNA.3-201ENST00000615048 90 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CRNDE-214ENST00000637011 865 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL136985.3-201ENST00000637377 2219 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CDY2B-202ENST00000544303 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CCDC62-203ENST00000392440 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 FKTN-202ENST00000357998 2404 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 PHF11-201ENST00000357596 1471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ZMYM6-203ENST00000373333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms