Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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CHAF1BQ13112 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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CHAF1BQ13112 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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CHAF1BQ13112 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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CHAF1BQ13112 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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CHAF1BQ13112 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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CHAF1BQ13112 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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