Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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