Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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HOXD10P28358 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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HOXD10P28358 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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