Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TO15178 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TO15178 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TO15178 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TO15178 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TO15178 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TO15178 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.5 ms