Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
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USP35Q9P2H5 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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USP35Q9P2H5 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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USP35Q9P2H5 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
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USP35Q9P2H5 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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USP35Q9P2H5 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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USP35Q9P2H5 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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USP35Q9P2H5 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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