Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms