Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 LINC01146-206ENST00000556684 361 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC006120.1-201ENST00000579375 546 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 BX005040.2-201ENST00000620504 370 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC016396.1-201ENST00000440189 328 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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VAMP3Q15836 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
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VAMP3Q15836 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC113383.1-205ENST00000502253 792 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 OR4N2-203ENST00000557677 1008 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC007950.1-201ENST00000560465 615 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RN7SL25P-201ENST00000583862 260 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 CARSP1-201ENST00000603171 889 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 PRR13P3-201ENST00000603578 376 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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