Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.8 ms