Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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