Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4AQ13619 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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