Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DUSP4Q13115 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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