Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 LINC01232-204ENST00000626729 2796 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 CAST-204ENST00000341926 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 CAGE1-208ENST00000512086 2537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AL354983.1-201ENST00000434580 906 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC093799.1-201ENST00000452411 499 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC087893.2-201ENST00000623272 255 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms