Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMTNP53814 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMTNP53814 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMTNP53814 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMTNP53814 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMTNP53814 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMTNP53814 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMTNP53814 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMTNP53814 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMTNP53814 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMTNP53814 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMTNP53814 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMTNP53814 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMTNP53814 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMTNP53814 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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