Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms