Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms