Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms