Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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