Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms