Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms