Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms