Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPXQ9UHP9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms