Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms