Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC30.57■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC30.57■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
KDM5BQ9UGL1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
KDM5BQ9UGL1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms