Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms