Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms