Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CMTM6Q9NX76 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms