Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms