Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms