Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms