Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TULP4Q9NRJ4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms