Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIT2Q9NQR4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms