Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms