Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms