Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZC3H12CQ9C0D7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZC3H12CQ9C0D7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms