Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms