Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms