Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms